Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms