Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zcchc18Q8VD24 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc18Q8VD24 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc18Q8VD24 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zcchc18Q8VD24 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms