Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam20bQ8VCS3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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