Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Trpm8Q8R4D5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trpm8Q8R4D5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trpm8Q8R4D5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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