Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmpQ8R373 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmpQ8R373 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms