Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Vmn1r200Q8R281 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmn1r200Q8R281 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmn1r200Q8R281 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmn1r200Q8R281 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmn1r200Q8R281 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r200Q8R281 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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