Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Impg1Q8R1W8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Impg1Q8R1W8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Impg1Q8R1W8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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