Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Colec12Q8K4Q8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms