Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ssh3Q8K330 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssh3Q8K330 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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