Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms