Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo18Q8K2I9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms