Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6bQ8K2H2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms