Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scara5Q8K299 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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