Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop1Q8K205 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop1Q8K205 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms