Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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