Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkn3Q8K045 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkn3Q8K045 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms