Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn2Q8CHX7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms