Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Upp2Q8CGR7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Upp2Q8CGR7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms