Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab43Q8CG50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab43Q8CG50 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rab43Q8CG50 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rab43Q8CG50 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rab43Q8CG50 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rab43Q8CG50 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab43Q8CG50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rab43Q8CG50 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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