Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms