Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd1bQ8CFT2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms