Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh13Q8CEE7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rdh13Q8CEE7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rdh13Q8CEE7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh13Q8CEE7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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