Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef8Q8CE24 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef8Q8CE24 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms