Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms