Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms