Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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