Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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