Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb1Q8CBF3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms