Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn5Q8CBA2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms