Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf2Q8CB19 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms