Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubqln3Q8C5U9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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