Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms