Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms