Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms