Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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