Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tnfsfm13Q8BXS2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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