Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms