Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pggt1bQ8BUY9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pggt1bQ8BUY9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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