Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms