Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smarcal1Q8BJL0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms