Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms