Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc50Q810U5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc50Q810U5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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