Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms