Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim50Q810I2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trim50Q810I2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim50Q810I2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim50Q810I2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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