Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NischQ80TM9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
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