Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Sgo2Q7TSY8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Sgo2Q7TSY8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Sgo2Q7TSY8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Sgo2Q7TSY8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Sgo2Q7TSY8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sgo2Q7TSY8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2Q7TSY8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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