Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms