Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vtcn1Q7TSP5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms