Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms