Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms